Im Gegensatz zu den meisten Aktiengesellschaften versteht sich die DEA Deutsche Eliteakademie AG nicht nur als Unternehmen, sondern auch als Lehreinrichtung und hat demzufolge ein Präsidium berufen aufgrund des Beschlusses der 1. Hauptversammlung vom 16.12.2003. Das Präsidium der Deutschen Eliteakademie besteht derzeit aus folgenden Personen:
Prof. Dr. med. Karl Dietrich Hepp ist Präsident der Deutschen Eliteakademie

Dipl.-Wirtsch.-Ing. Günter H. Hober – Vizepräsident der Deutschen Eliteakademie.

Prof. Franz Schilke – Vizepräsident der Deutschen Eliteakademie.

Prof. Dr. med. Erich Kröger – Mitglied des Präsidiums

Prof. Dr. med. Dr. habil. E. R. Weissenbacher – Mitglied des Präsidiums

Das Präsidium besteht demnach aus fünf Personen, dem Präsidenten und zwei Vizepräsidenten, sowie zwei Mitgliedern. Der Aufsichtsrat bestimmt und ernennt die Mitglieder des Präsidiums, die Wahl des Präsidenten erfolgt vom Präsidium. Darüber hinaus können weitere Mitglieder vom Aufsichtsrat berufen werden.